יחידת רשם העמותות מהווה חלק מתחום המלכ"רים ברשות התאגידים. תחום המלכ"רים כולל גם את יחידת רשם ההקדשות, אשר צורפה ליחידת רשם העמותות בשנת 2004. במסגרת תחום זה מטופלים עמותות, הקדשות וחברות לתועלת הציבור.